Fragment-Based Screening
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Cribado basado en fragmentos para el descubrimiento integral de cabezas de serie

El cribado basado en fragmentos (FBS, por sus siglas en inglés) es un método ampliamente aplicado en el descubrimiento de moléculas de cabezas de serie basado en fragmentos (FBLD, por sus siglas en inglés). Ha superado al cribado de alto rendimiento (HTS, por sus siglas en inglés) como método más popular para el cribado de moléculas debido a que se necesitan muchos menos compuestos para el cribado y la síntesis, lo que produce un índice de compuestos hit en el cribado de moléculas mayor que los métodos tradicionales.

El FBLD también aporta un mayor índice de éxito al generar series químicas con propiedades similares a las de los cabezas de serie, lo que permite un espacio estructural para sustancias químicas notablemente mayor con menos compuestos. Las bibliotecas de fragmentos se caracterizan por el pequeño tamaño de los compuestos y por el bajo número de moléculas candidatas. Después de identificar las moléculas que pueden tener afinidades iniciales débiles o medias con las proteínas diana deseadas, estos cabezas de serie se optimizan para obtener afinidades medias o fuertes. En cada una de las etapas, una espectroscopia de RMN muy sensible se encarga de detectar las interacciones con proteínas fragmentadas.

Existen diferentes métodos biofísicos para el FBS, entre ellos la RMN es el más popular. El cribado de fragmentos basado en RMN se emplea idealmente para detectar ligandos de poca afinidad en los cribados primarios y permite el control de calidad de la biblioteca de cribados, por ello esta tecnología es superior a muchos otros métodos.

En pocas palabras, la RMN hace que el FBS resulte más sencillo en el campo del descubrimiento de cabezas de serie mediante la producción de productos hit de gran calidad. El software complementario, en combinación con herramientas innovadoras de FBS, puede acelerar enormemente los análisis de datos durante el cribado de fragmentos basados en RMN, ya que incorpora todos los datos del cribado en un mismo lugar y cuenta con procesos manuales automatizados.

La herramienta de cribado basado en fragmentos de Bruker aprovecha los datos de la RMN y simplifica todo el flujo de trabajo, desde la adquisición hasta el análisis. Todos los datos relevantes, los tipos de experimentos, la identificación de compuestos, los espectros de referencia y demás información se recopilan de forma automática, se almacenan en un archivo y en la pantalla se muestran los datos relevantes para el análisis.