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Le HTS-XT est contrôlé par le logiciel OPUS qui permet la mesure et l'évaluation des spectres obtenus d’un grand nombre d'échantillons.

Pour la détermination quantitative, d’échantillons complexes avec une ou plusieurs variables, des méthodes multivariées comme la PLS (Partial Least Squares) sont utilisées.

Pour effectuer des analyses qualitatives, des algorithmes tels que la corrélation de spectres, l’ACP (Analyse en Composantes Principales) et l’ANN (Réseau de neurones) sont disponibles.

Le stockage des paramètres de mesure et des résultats est effectué dans un fichier journal ( logfile) permet un transfert facile de ces données vers des programmes externes ou un LIMS.