HDX SL 530x245

Rozwiązanie Bruker HDX do zautomatyzowanej charakteryzacji konformacji

Rozwiązanie Bruker HDX kompletny zestaw narzędzi łączący LEAP HDx PAL, pompę UHPLC, Bruker maXis II ETD i oprogramowanie Sierra Analytics HDExaminer. 

Wykorzystując najbardziej zaawansowany, niezależny system (MS) HDX. Zapewniona jest również solidność i niezawodność LEAP HDx PAL, które są wbudowane w standardzie. LEAP HDx PAL automatyzuje przebieg pracy HDX, planuje i wykonuje oznaczone eksperymenty, po czym następuje hartowanie i podawanie w niskich temperaturach.

Innowacyjne, inteligentne planowanie podawania próbek

Jedną z kluczowych wyzwań wprowadzenia HDX-MS w wiek automatyzacji i do bio-laboratoriów farmaceutycznych jest implementacja innowacyjnego oprogramowania do harmonogramowania. Problem ten rozwiązuje oprogramowanie Chronos, dołączone do LEAP HDx PAL.

 

Oprogramowanie to maksymalizuje wydajność chromatograficzną, a tym samym wydajność laboratoryjną przez inteligentną organizację i planowanie etapów przygotowania próbki, w tym etykietowania, inkubacji, trawienia i hartowania.

Optimised Scheduling afforded by the Chronos software provided with the LEAP H D X PAL

Wysokiej jakości chromatograficzne i dane MS

Representative Heat Map produced in Sierra Analytics HDExaminer software

Separacja chromatograficzna w UHPLC, po której następuje detekcja MS przy użyciu  Bruker maXis II z dokładnością masy sięgającą poziomów ppm, wysoką czułością i dokładnością izotopową gwarantuje wysoką jakość uzyskanych danych i w efekcie pewność stosunku H/D.

 

Wiodące na rynku możliwości ETD otwierają nową erę w eksperymentach HDX-MS. Zdolność do poszerzania wiedzy poprzez badanie na poziomie pozostałości, nie tylko na poziomie peptydu, potencjalnie daje dodatkową specyficzność i uwidacznia potencjalne hotspoty. Możliwe są również badania Top-down i middle-down, dostarczają danych uzupełniających do tych uzyskanych z tradycyjnych eksperymentów HDX-MS opartych na trawieniu pepsyną z badania bottom-up.

 

Najpowszechniej używane oprogramowanie do interpretacji danych HDX-MS


Zdolność do interpretowania i analizowania danych spektroskopii masowej zapewniających kompleksowy obraz zachowania wykrywania białka przez deuterację zapewnia oprogramowanie Sierra Analytics HDExaminer. Jest to najbardziej rozpowszechnione rozwiązanie otwarte dla rozwiązań innych producentów. Cechujące się wysokim stopniem funkcjonalności oraz łatwością użytkowania.

 

Obejrzyj film na temat oprogramowania Sierra Analytics HDExaminer, aby dowiedzieć się, w jaki sposób może pomóc w interpretacji wyników eksperymentów HDX-MS:

Wizualizacja i statystyki

Informacje i spostrzeżenia uzyskane po analizie danych mogą być wykorzystane do sondowania zmian konformacyjnych struktury białka w obecności zaburzeń.

 

The regions responsible for the changes can be readily visualized by linking to crystal structure visualization programs such as PyMol.

Crystal structure representations of the protein HtpG undergoing undergoing structural changes in the presence of ATP based on data from HDX MS experiments