应用文档 - 磁共振

布鲁克用户库的新进展:一系列快速、 灵敏度增强型TOCSY和NOESY生物分子NMR实验

多维TOCSY和NOESY是同核NMR相关实验的基础。低灵敏度是这些极化转移方法固有的缺点,特别是对于涉及快速弛豫或快速交换、不稳定质子的系统。

多维TOCSY和NOESY是同核NMR相关实验的基础。低灵敏度是这些极化转移方法固有的缺点,特别是对于涉及快速弛豫或快速交换、不稳定质子的系统。我们最近引入了环投影波谱法(L-PROSY),1这是一种利用弛豫和交换来增强酰胺、羟基和胺基的NOESY和TOCSY交叉峰的方法。

本文将介绍一系列实验,基于频率选择性饱和(或)循环反演程序,单位时间可获得更大的灵敏度增益。2然后,假设频谱稀疏,且可对不同的频率特定的“通道”(峰值)进行单独处理,则与传统或L-PROSY相比,扫描速度要快得多(扫描次数少),且灵敏度更高(单次扫描)。

实验以磁化转移(MT)现象为基础,图1A和1B给出了其序列。在这些实验中,可交换(或快速弛豫)质子通过长单色饱和脉冲(同一自旋池内关联的选择性MT–SMT)或按哈达玛编码法(哈达玛MT–HMT用于波谱上不同的自旋池之间的相关性)依据一系列反转脉冲顺序寻址。3 MT过程使人想起在CEST中发生的过程,其中不稳定质子的饱和度因溶剂补充而放大,4然后在产生的同核交叉峰中提供显著增强;而选择性辐照策略只需正常2D实验获取时间的一小部分。

我们在此提供用户友好的脉冲程序,支持使用WaveMaker建立这些特形脉冲实验,包括在SMT中选择性激发和重新聚焦的可能性,以及在HMT中水倒转的可能性,二者都能在水溶液中实现短循环时间。

这些方法具有通用性,可用于指向小分子、多糖、RNA和蛋白质系统中的快速交换(弛豫)质子。图1C和1D说明了它们在5_SL5B+C、SARS-CoV-2 RNA片段的亚氨基质子上的使用:SMT版用于增强亚氨基-亚氨基NOESY相关谱,而HMT版在亚氨基质子和RNA中的其它质子之间提供了NOESY的连接性,并增加了多路复用的优势(注意:不要尝试用HMT在相同的质子池中建立相关性,因为自旋动力学根本不起作用;用SMT代替)。请注意,这些实验可以在常规场中实现,但是可以从超高场操作中受益,其中波峰被更好地分离(对于哈达玛编码很重要),且T1较长(对于增强相关性的MT方面很重要)。

图1。A) 选择性 MT 实验 (SMT) 的脉冲序列,旨在通过使用长顺序饱和脉冲进行编码和选择性自旋回波进行检测,从而提供快速的 imino-imino NOESY 相关性,从而允许非常短的扫描间延迟(0.3 = 0.5 s)。B) 哈达玛德MT实验(HMT)的脉冲序列,旨在提供与RNA中其他质子的快速伊莫诺相关性,利用循环反转脉冲和水门3919水抑制方案。C) SARS-CoV-2的5_SL5B+C RNA片段的SMT imino相关性,提供在+80分钟内获得的伊米诺顺序行走。D) HMT 频谱在水门 3919 水抑制块中应用 15N MQ 滤波器后显示(黑色)和(红色)。每个 HMT 相关性在 40 分钟内获得;为了进行比较, 单个传统的 Jr Noesy 需要 > 24 hs 才能提供具有类似灵敏度的这些相关性。作为COVID-NMR工作的一部分,使用配备TCI低温的AvanceNEO以1GHz的速度采集数据。

参考文献

  1. Novakovic, M.; Cousin, S. F.; Jaroszewicz, M. J.; Rosenzweig, R.; Frydman, L. Journal of Magnetic Resonance 2018, 294, 169.
  2. Novakovic, M.; Kupče, Ē.; Oxenfarth, A.; Battistel, M. D.; Darón, I.; Schwalbe, H.; Frydman, L. arXiv: 2004.13063
  3. Kupče, E.; Nishida, T.; Freeman, R. Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy 2003, 42 (3–4), 95.
  4. Van Zijl, P. C. M., & Yadav, N. N. Magnetic Resonance in Medicine, 2011, 65(4), 927.
  5. Kupče, E.; Freeman, R. Magnetic Resonance in Chemistry 2007, 45 (1), 2.