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蛋白组学和蛋白质分析:引领4D组学的新革命

在过去的20年中,蛋白组学在新技术和新的方法学方面取得了显著的进步,使它成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的极其强大的研究工具。

timsTOF Pro™与革新性的PASEF™ 数据采集模式的结合,不仅在扫描速度、灵敏度、选择性和稳定性方面突破了新界限,而且使4D蛋白组学方法能助力科学家们对之前无法企及的蛋白质组做常规探索。

关于挑战和解决方案

对生物组织和生物体液中蛋白质做直接的分析检测对分析界是一个极大的挑战。蛋白质的表达,随着个体的基因背景而变化,但也随着时间、位置的改变而变化;以及对作为外界刺激(如压力、疾病、衰老、努力……)的生理学响应而发生改变。而且,由于不同的选择性剪接、点突变、翻译后修饰、内源酶解等的协同作用,一个特定的蛋白质(基因表达产物)会被表达为不同的、具有特定生物功能的蛋白质变体(proteoforms)

解决复杂性的全面解决方案只能通过正交性实验方法来获得。为了应对这些挑战,布鲁克提供一整套专门的解决方案。

使用4D蛋白组学建立新标准

由PASEF技术 助力的timsTOF Pro,第一次使得超高灵敏度的鸟枪法蛋白质组学以及对大规模样品中的蛋白质进行相对高通量的相对定量成为可能,并对低丰度样品进行前所未有的稳定测量也具有成为现实。

timsTOF Pro和timsTOF fleX都配备了捕集型离子淌度技术(TIMS)模块,可以用于精确测定所有待测离子的碰撞截面积(CCS)值。对于各种数据采集方法,这一特性能够极大地提高选择性(无论采取哪种数据采集策略):4D的运行间匹配(MBR)提高了数据依赖性采集(DDA)PASEF方法的定量能力,与此同时,diaPASEF为数据非依赖性采集(DIA)方法的选择性和灵敏度建立了新标准。

Dealing with proteomics samples complexity
应对蛋白组学样品的复杂性:展开到如下的四维空间以降低复杂性
1 – 保留时间
2 – 质荷比
3 – 强度丰度
4 – 淌度

描绘PTM的性质和特征

深度的PTM(磷酸化,糖化…)和蛋白表征,利用TIMS和Q-TOF的组合带来了灵敏度和分离能力的优势,或者是来源于MALDI TOF-TOF独特的碎裂模式,两者都促进了对翻译后修饰(磷酸化,糖化…)和蛋白质深入的表征

揭示出隐藏的信息:蛋白质变体的表征

蛋白质变体的轮廓分析与表征的解决方案,充分利用了布鲁克UHR-Q-TOF的特性来检测复杂的蛋白质变体的模式,而这些样式恰恰是在标准的自下而上流程中无法获得的。

Proteoform Profiling

增加了位置信息

新的成像解决方案是可以使得空间定位组学能真正地把基于生物组织的多肽表征与深入的、在在所选的细胞的子集水平上的蛋白组学研究联系起来。

SpatialOMx approaches

Poster hall Proteomics

For Research Use Only. Not for Use in Clinical Diagnostic Procedures.