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Protéomique

Découvrir comment les solutions analytiques personnalisées et avancées de Bruker en protéomique aident à identifier de nouveaux médicaments potentiels pour un traitement et un diagnostic réussis.

Protéomique et analyse des protéines : émergence d'une révolution 4D

Ces deux dernières décennies, des progrès significatifs en matière de technologie et de nouvelles méthodologies ont fait de la protéomique un outil extrêmement puissant pour les scientifiques, les biologistes et les chercheurs cliniciens s’intéressant aux protéines. L’introduction du timsTOF Pro couplé au mode d'acquisition révolutionnaire PASEF repousse non seulement les limites en termes de vitesse, de sensibilité, de sélectivité et de robustesse, mais permet également des approches de protéomique 4D pour explorer de manière usuelle des parties du protéome qui étaient jusqu’ici inaccessibles.

 

L'analyse directe des protéines de tissus ou de biofluides soulève de nombreux défis analytiques. L’expression d'une protéine varie en fonction du bagage génétique d'un individu, mais également du temps, de la localisation et d’une réaction physiologique aux stimuli externes (stress, maladie, âge, effort...). Qui plus est, compte tenu des effets combinés de l’épissage alternatif, de la mutation ponctuelle, des modifications post-translationnelles et de la protéolyse endogène, une protéine donnée (produit d’expression du gène) peut être exprimée par de nombreuses formes de protéome différentes ayant chacune une activité biologique dédiée. Seules des approches orthogonales permettent de parfaitement maîtriser cette complexité. Bruker offre un panel de solutions spécifiquement conçues pour surmonter ces défis.

Définition de nouvelles normes avec la protéomique 4D

Le timsTOF Pro alimenté par PASEF permet pour la première fois la protéomique rapide et ultra-sensible par fusil de chasse et une quantification relative des protéines à haut débit sur un vaste groupe et des études d'échantillons de faible abondance, à un niveau de solidité sans précédent.

Le timsTOF Pro et le timsTOF fleX sont équipés d’un module de spectrométrie à mobilité ionique piégée (TIMS) qui permet de déterminer précisément les valeurs d'une section transversale de collision (CCS) pour tous les ions détectés. Cette propriété intrinsèque augmente de manière significative la sélectivité, quelle que soit la stratégie d’acquisition : 4D Match Between Runs augmente la performance de quantification dans les approches PASEF de l’ acquisition dépendante de données (DDA) alors que dia-PASEF définit de nouvelles normes de sélectivité et de sensibilité pour l’acquisition indépendante de données (DIA).

Dealing with proteomics samples complexity : Reducing complexity by spreading it into a 4th dimension 1 – Retention Time 2 – Mass to charge ratio 3 – Intensity 4 –Ion Mobility

 

For Research Use Only. Not for use in clinical diagnostic procedures.