SCiLS™ Lab

ブルカーのソフトウェアを使用することで、MALDIイメージングデータの統計解析がこれまでになく簡単になりました。

基本の可視化と処理

• イオン画像とスペクトルを瞬時に可視化
• 数多くの可視化オプション
• 使いやすい計算ツール

• 事実上サイズ無制限のデータセットのための高度な機械学習アルゴリズム
• 識別可能なm/zマーカーを明らかにするための比較分析
• 相関するm/z値の発見のための共局在化解析
• 空間セグメンテーションによる顕著な特徴の自動アノテーション
• 基礎となるトレンドを抽出するための成分分析
• 臨床試験および前臨床試験における領域の特徴付けのための複数のアノテーション
• ラベルフリーサンプルの分類のための分類モデル
• MSイメージングデータの絶対定量
• 組織ベースの SpatialOMx ワークフローをサポートし、組織内の検出された化合物の分布を可視化

• 三次元モデルの構築・可視化・解析

システム要件
以下のシステム要件に該当します。

• インテル Core i7 プロセッサーまたはインテル Xeon プロセッサー(同等以上)
• Microsoft Windows 7 64ビットまたはMicrosoft Windows 10 64ビットオペレーティングシステム
• 32GB RAM
• SATA III ソリッドステートドライブ(SSD)
• フルHDディスプレイ（1920×1080）
• OpenGL 3.2をサポートするグラフィックスカード

SCiLS Lab™ は、ブルカーの FLEX シリーズや MRMS などを含む主要な質量分析メーカーからのデータに加え、オープンな imzML フォーマットで提供されるデータセットを統合します。

複数のサンプルの比較分析を 2D と 3D の両方で可視化することができ、医薬品開発、組織分解バイオマーカー研究、免疫組織化学を補完するトランスレーショナルな病理学研究など、多くのアプリケーションを可能にします。

SCiLS Lab™ の MSI 定量化ワークフローは、組織から直接標的分子を簡単に定量することを可能にします。SCiLS™ LabはMetaboScape® のSpatialOMxワークフローと統合し、アノテーションされた検出成分（代謝物、脂質、糖鎖）のMALDI分子組織イメージを可視化します。

timsTOF fleXイオンモビリティデータについて、SCiLS Labはモビリティ画像を表示することができ、CCSを考慮したデータ解釈を可能にします。

臨床病理学における大規模コホートサンプル
先駆的なバイオマーカー研究では、 識別イオン の発見は手動で行うか、カスタムスクリプトを使用して行われていました。バイオマーカー研究では分析すべきサンプル数が膨大なため、手動でのデータ分析は時間がかかり、エラーが発生しやすいです。SCiLS Labでは、病態生理学的変化を識別する特徴的なスペクトルの自動解明を簡単に行うことができるようになりました。SCiLS Labは、ワンクリックですべてのイオンが異なる生物学的状態をどの程度識別しているかを自動的に定量化します。結果として得られた新規バイオマーカー候補のリストは、その後の分析のために簡単にエクスポートすることができます。

SCiLS™ Labのパワフルなデータマイニング機能をご覧ください。

全身イメージング
2006 年に実施された先駆的な研究において、全身 MALDI イメージングは、方法論だけでなく計算の側面にも挑戦しました。全身組織切片内の 薬物および代謝物の分布 を可視化するために、商用、学術用、およびカスタムのさまざまなソフトウェアを使用して、いくつかの手動データ処理が実行されました。

現在では、何百万ものスペクトルからなるデータセットのすべての処理が、1つのソフトウェアを使用して実行できるようになりました。SCiLS™ Lab は、1つの解析ファイルへの複数のデータセット登録から、スペクトルの前処理、包括的な統計解析まで、データ解析のワークフロー全体を提供します。