iprm-PASEF^®

正確な分子アノテーションは、生物学的サンプルの生化学的変化を理解するために不可欠です。MALDIイメージングによる分子同定の精度を向上させるために、iprm-PASEF^®は、分子構造の帰属の信頼性を高める新しいツールです。

m/z値、同位体パターン、イオンモビリティ由来のCCS値にMS/MSデータを追加することで、ブルカー独自のMetaboScape^®ソフトウェアでスペクトルマッチングが可能になります。このハイスループット、マルチプレックスMS/MSベースのフラグメントイオン画像に基づく分子アノテーションシステムを、空間的にフォーカスしたワークフローにご活用ください。

iprm-PASEF^®はターゲットMALDI-MS/MSイメージングワークフローで、革新的なPASEF^®テクノロジーにより、iprm-PASEF^®取得の各ピクセルで連続的に断片化される25種類のプレカーサーの選択が可能です。

STEP 1: ターゲットプレカーサーを選択するためのサーベイとして、CCS対応のMALDIイメージングを実行します。SCiLS^™ Labにデータセットをインポートし、T-ReX^®のフィーチャーファインディングアルゴリズムを用いてマスモビリティーフィーチャーを生成します。SCiLS^™に内蔵されたツールを用いて目的のフィーチャーをフィルタリングし、(オプションで) iprm-PASEF^®取得をサンプルの特定の領域にフォーカスするために関心領域にアノテーションを付けます。ターゲットプリカーサーの選択を終了するには、SCiLS™のiprm-PASEF^®パラメータをエクスポートします。

STEP 2: iprm-PASEF^®メソッドを設定し、SCiLS^™ iprm-PASEF^®パラメータをtimsControlとflexImaging（関心領域が定義されている場合）にインポートします。iprm-PASEF^®データセットを取得し、SCiLS^™ autopilotを使用してSCiLS™ Labファイルを自動生成します。T-ReX^®フィーチャーファインディングアルゴリズムを使用して、マスモビリティーの成分を生成します。iprm-PASEF^®データセットでは、マスモビリティーのフィーチャーはターゲットプリカーサーごとに自動的にグループ化され、それぞれがフラグメントまたはプリカーサーとして特徴付けられます。

SCiLS^™ Labでプレカーサーイオンとフラグメントイオンのイメージを可視化、比較、フィーチャーリストを管理し、MetaboScape^® による分子アノテーションをSCiLS^™ Labで使用して、m/z値、同位体パターン、イオンモビリティ由来のCCS値、MS/MSスペクトルを使用してプリカーサーをアノテーションします。

iprm-PASEF^®で生成されたデータは、MetaboScape^®が提供する自動アノテーションワークフローと互換性があります。規則に基づくLipid Speciesアノテーションワークフローを使用して脂質を同定し、フラグメントイオン画像にアノテーションを付けたり、ターゲットリストアノテーション法をインシリコフラグメンテーション（InChIまたはSMILESコードが必要）またはスペクトルマッチング（スペクトルライブラリーが必要）と組み合わせて使用し、プレカーサーを同定します。

アノテーションの質は、確立されたMetaboScape^® Annotation Quality (AQ)スコアリングを用いて表現され、分子同定の報告に必要な信頼性を提供します。

timsTOF fleXの実績のある技術、smartbeam 3DレーザーポジショニングとmicroGRIDを使用して、iprm-PASEF^®マルチプレキシングを次のレベルに引き上げましょう。smartbeam 3Dレーザーの正確なレーザーポジショニングを利用して、ピクセルの表面積を個別のサブピクセルに細分化し、データ品質を損なうことなくサンプルを再分析します。

timsTOF fleXのポテンシャルをフルに活用し、異なる極性でのサーベイスキャンとiprm-PASEF^®の取得を組み合わせた測定シーケンスを作成することで、関連化合物を同定したり、複数のプレカーサーリストを生成し、それを順番に分析するだけで、マルチプレクシングを次のレベルに引き上げます。