iprm-PASEF^®

准确的分子注释对于理解生物样本中的生化变化至关重要。为了提高 MALDI 成像中分子鉴定的精确性，推出了 iprm-PASEF^® 技术，它能极大地提升分子鉴定的置信度。

在一级质量数、同位素轮廓及基于离子迁移率的 CCS 值的基础上，又增加 MS/MS 数据，能够充分的发挥布鲁克的 MetaboScape^® 软件谱图匹配功能。将其用于您所聚焦的空间组学工作流程中，可建立针对目标分子的高通量、多通道、MS/MS 分子注释工作流程。

iprm-PASEF^® 是一种靶向 MALDI-MS/MS 成像工作流程，其中，革命性的 PASEF^® 技术能够在每个 iprm-PASEF^® 像素中选择 25 个前体离子，并进行自动化的连续碎裂。

步骤 1 ：执行一个开启 TIMS 离子淌度的 MALDI 成像采集，进而筛选目标前体离子。将数据集导入到 SCiLS™ Lab 软件中，并使用 T-ReX^® 算法进行分子特征提取。（可选方法）利用 SCiLS™ 内置的工具筛选感兴趣的分子特征，并标注感兴趣区域，以便将 iprm-PASEF^® 采集集中在样本的特定区域。在完成目标前体离子的选择后，导出 SCiLS™ iprm-PASEF^® 参数。

步骤 2 ：设置 iprm-PASEF^® 采集方法，并将 SCiLS™ iprm-PASEF^® 参数导入 timsControl 和 flexImaging 中。进行 iprm-PASEF^® 数据采集，并成像数据自动导入生成一个 SCiLS™ Lab 文件。使用 T-ReX^® 算法进行分子特征提取。在 iprm-PASEF^® 数据集中，目标前体离子会根据质荷比、CCS 值自动分组，分别被标记为前体离子或碎片离子。

在 SCiLS™ Lab 中可视化和比较前体离子和碎片离子图像，以整理特征列表，并利用 SCiLS™ Lab 内嵌的分子注释功能（由 MetaboScape^® 驱动），通过质荷比（m/z）值、同位素轮廓、CCS 值和 MS/MS 谱图对前体离子进行注释。

iprm-PASEF^® 生成的数据与 MetaboScape^® 提供的自动分子注释工作流程相兼容。可以使用 rule-based Lipid Species annotation 来鉴定脂质并注释碎片离子图像，也可以将目标列表注释方法与计算机模拟碎片化（需要 InChI 或 SMILES 代码）或谱图匹配（需要谱图数据库）相结合来鉴定前体分子。

注释的结果通过 MetaboScape^® Annotation Quality（AQ）来评分，为最终的分子鉴定结果提供了置信度评级。

利用 timsTOF fleX 的成熟技术，例如 smartbeam 3D 激光及 microGRID 模块，将 iprm-PASEF^® 多通道采集性能提升到新的高度。借助 smartbeam 3D 激光的精准定位，将每个像素点进一步细分为离散的“子像素”，并在不降低数据质量的前提下进行样品的再次分析。

充分发挥 timsTOF fleX 的全部潜力，将不同极性全扫描与 iprm-PASEF^® 采集相结合，以识别相关化合物，或者通过生成多个前体列表并按次序进行自动分析，将多通道采集性能提升到全新的高度。