製薬向けのNMR & ESRソリューション

リード化合物の発見と最適化

生理的条件における構造情報を豊富に提供するNMRソリューション

ハイライト

概要

フラグメントライブラリーの品質チェック、カクテルデザイン、ヒット化合物の自動同定から、解離定数(Kd)の定量的評価およびリガンドの3D解析におよぶ完全なワークフローです。

ライブラリーの定義

  • Mnova Gears, Verify および qNMRによるフラグメント化合物ライブラリーの品質チェック
  • MixDesignによるカクテルデザイン

 

ライブラリースクリーニング

  • SampleJetによるスクリーニングサンプルの取り扱い
  • 標準およびカスタマイズ可能な1Hおよび19F NMRスクリーニング実験を自動で実行
  • CryoProbe(QCIF)による 1H および 19Fの高感度測定
  • FBSとMnova Screenを用いることで 1H および 19Fのヒット検出を自動化

 

構造生物学

Mnova Bindingは、タンパク質-リガンド滴定2D HSQCを自動で処理し、ピークの動きを追跡し、複数のピークのKdを計算します。

 

リード化合物の最適化

溶液中の遊離リガンドがとっている立体構造は、ターゲット医薬品との結合親和性に影響を与えます。従って三次元構造解析は、リード化合物の最適化を加速するために役立ちます。
Mnova StereoFitter は、各種NMR実験(qNOE、化学シフト、Jカップリング)を活用して、三次構造のグループを生成します。

特長

特長

  • IconNMRを用いた 1H および 19F NMRスペクトルの自動測定。デフォルトの実験は、ブルカーライブラリーに含まれます。
    - 溶媒消去付き1H NMRスクリーニング実験:1H 1D、飽和移動差スペクトル(Saturation Transfer Difference, STD)法、waterLOGSY法
    - T2 および T1rho
    - 19F デカップリング、スクリーニング実験
  • TopSpinのフラグメントベースのスクリーニング機能は、スペクトル測定と解析の橋渡しをします。スペクトルを測定すると、Mnova Screenによってデータが自動解析されます。 結果はPower Pointのようなフォーマットで、Mnova Screenに表示されます。
  • タンパク質のシグナルを観察するスクリーニングでは、化学シフト摂動 (CSP)法を使用します。リガンドの量を増加させ、ターゲットのH-C相関実験(HSQC)を行います。 データはMnova Bindingで解析し、データの可視化とKdの算出が行われます。
  • Mnova StereoFitterは、様々な形式のNMR実験データを元に、三次構造およびコンフォメーションの可能性を計算します。現在、StereoFitterは、最適な三次構造の候補を計算するために、4種類の異なるタイプの実験データ、即ちNOE, RDC, Jおよび化学シフト、を扱うことができます。
  • ワークフローは、Mnova DBを使用して、例えば、フラグメントスクリーニング実験中に頻繁に使用されるスクリーニングデータやフラグメントの1Dスペクトルなどを保存することができるように、強化することができます。

利点

利点

  • フラグメント結合に対するNMRの感度は、フラグメントが予想される弱い親和性の範囲(解離定数Kdは[μM]から数[mM]の範囲)と、理想的に一致します。
  • NMRスクリーニング実験では、結合情報とリガンドの構造情報を提供します。
  • NMRは、溶液中のリガンドの構造を実験的に決定(三次元解析)し、溶液と結合状態の間の構造変化を解明するユニークな手法です。
  • 19F NMRシグナルはリガンド由来から得られ、またそれは幅広いスペクトルに分離して観測されることが、19Fスクリーニングを魅力的な手法にしています。
    -  30種類のフラグメント混合物に対応
    -  T2の影響が強く高感度
    -  選択性:フッ素を含まないタンパク質サンプル
    -  市販の19F フラグメント化合物ライブラリー
  • 典型的なスクリーニングでは、何百ものスペクトルを生成することができます。自動化された堅牢なデータ解析ソフトウェアによって、マニュアル操作は最小限で済み、再現性に優れたリード化合物の発見や最適化が可能です。
  • 必要なソフトウェアツールはすべて、新しいLead discovery and Optimisation製品に含まれています。詳細についてはお問い合わせください。

アプリケーション

ウェビナー

サポート

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ブルカーは、最初のお問い合わせから評価、据え付け、その後装置が寿命を迎えるまでの購入サイクル全体を通して、お客様に比類のないサポートを提供することをお約束します。

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