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信頼性の高い化合物同定のためのスペクトラルライブラリ

サンプルから知識まで:正確な化合物同定を通してより深いメタボロミクス研究を実現します。

代謝物は、広いダイナミックレンジが要求される低分子量成分の極めて複雑な混合物です。さらに 分析対象となる物質の数は、哺乳動物、微生物および植物由来の内因性および外因性の代謝物などを含み、膨大な数にのぼるため、代謝データの生物学的状況を完全に理解するためには成分同定が非常に重要な意味をもちます。

したがって、デレプリケーションの手法となる以前に記載した既知のターゲット代謝産物のアノテーションは重要になり、自動かつ決定的であることが望まれます。

生物学的状況の観察においては、化合物が高い信頼度で同定された場合にのみ意味を成します。 この信頼性は、関連する内因性および外因性の代謝産物を含むスペクトルライブラリおよびデータベースに収められた複数の基準値をクリアすることで獲得されます。

Bruker QTOFシステムで取得された高品質のLC-MS / MSデータで構築されたスペクトルライブラリには、信頼性の高い成分同定を実現可能にする、精密質量、同位体パターン情報、MS / MSスペクトルおよび保持時間情報、CCS値の情報が含まれています 。 MetaboScapeは、ユーザーが自由に決めることができるしきい値レベルに従って、このライブラリ情報との照合により成分同定を行います。MetaboScapeでは、グラフィカルな「Annotation Quality :AQ」が示され、皆様は自動的に生成された評価値から容易に定性結果を判定することができます。

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既知の化合物を自動的かつ決定的に同定するこの機能は、メタボロミクス研究により有効な手法を提供します。

迅速かつ信頼性の高い代謝産物デリプリケーションのための統合ソリューション

いくつかの相補的なスペクトルライブラリは、既知の化合物を自動かつ確実に同定するために統合されたMetaboScapeワークフローソリューション内でサポートされています。 これらの代謝産物ライブラリには、Bruker HMDB代謝物ライブラリー、Bruker MetaboBASE Personal Library、Bruker MetaboBASE Plant Libraryおよびカスタムライブラリがあります。 これらのスペクトルライブラリはPC上に保存され、プライバシー問題を解消するため、ローカル検索機能もご利用いただけます。

Bruker MetaboBASE Personal Library 2.0

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米国カリフォルニア州、ラホーヤにあるメタボロミクス スクリプスセンターのGary Siuzdak教授と共同で作成したBruker MetaboBASEパーソナルライブラリ2.0は、14,000種類以上の化合物のMS / MSスペクトルが含まれています。 全てのスペクトルはBruker QTOFシステムにより取得しました。

このライブラリの233,000種類を超える化合物のイン・シリコ  MS / MSスペクトルは、十分な純度の標準試料が入手できないターゲットに対して迅速な同定手法を提供することになります

Bruker HMDB Metabolite Library 2.0

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Bruker HMDB(Human Metabolome Data Base)代謝物ライブラリは、Brukerによって提供されたものであり、University of Alberta(カナダ)のLiang Li教授とDavid Wishart教授のチームと共同で作成されました。 化合物はHMDBから選択され、尿、血液、その他の生体液および細胞抽出液から見出される関連代謝物を含みます。

この厳選されたライブラリの第2版では、代謝物アノテーションの信頼性を高めるために重要な、約800種類のMS / MSスペクトルと約600種類の保持時間情報が含まれています。

ヒューマンメタボロームデータベースベースプロジェクトに関する詳細は、www.hmdb.caをご覧ください。

Bruker MetaboBASE Plant Library

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Bruker MetaboBASE Plant Libraryには、フラボノイド、フェノール、サポゲニン、有機酸など約300種類の植物代謝物が約1300種類含まれています。
このライブラリは、Lloyd W. Sumner教授(現ミズーリ州立大学、米国ミズーリ州コロンビア)、Dennis Fine博士、Daniel Wherritt博士(Noble Foundationの植物生物学部門、米国オクラホマ州アードモア)と共同で作成しました。

このライブラリは、弊社 Brukerが Metabolomics研究のコミュニティにおける貢献度を示すオープンソースライセンスにおいてご利用いただけます。

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質量分析データの共有化およびコミュニティキュレーションによる利益

MetaboScape 4.0は、オープンソースで提供されているライブラリのサポートもしています。

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