GlycoScape

GlycoScape™ は効率性とコスト低減を実現します

現在の装置とサンプルの状態を知らせるリアルタイム解析

分析時間

糖ペプチドの同定には時間がかかることが知られています。データ取得が完了するとすぐに結果が出力されるため、このステップは不要になります。

費用

計測時間、試薬、サンプルの調製にはコストがかかります。GlycoScape™ の Run & Done を使用すると、次のサンプルを注入する前に意味のあるデータが生成されていることが保証されるため、コストを節約できます。

装置の時間

お客様にとって一分一秒が重要であることを私たちは理解しています。GlycoScape™ を使用すれば、装置の時間を最も生産的な方法で活用できることが保証されます。

貴重なサンプル

貴重なサンプルを節約します! 糖ペプチドのサンプル調製には時間がかかり、コストもかかります。GlycoScape™ のスマートな機能により、貴重なサンプルが無駄にならないようにします。

リアルタイム検索結果とスマートなデータ取得機能を備えた 4D-グライコプロテオミクス

GlycoScape™ が提供するリアルタイムの糖ペプチド同定とスマートなデータ取得機能を統合することで、データ分析のボトルネックを克服します。

普遍的に利用可能
現在および将来のすべての timsTOF Pro、timsTOF HT、timsTOF fleX、timsTOF SCP、および timsTOF Ultra プラットフォームは、GlycoScape™ にアクセスできます。GlycoScape™ は、追加費用なしで Bruker ProteoScape™ とバンドルされています。

4D-グライコプロテオミクス
CCS 対応データのサイズが大きい場合でも、GlycoScape™ を使用すれば、リアルタイムの糖ペプチド同定が可能になります。GlycoScape™ は、ペプチド同定に GPU 搭載の ProLuCID アルゴリズムを使用し、糖鎖組成には Myriad アルゴリズムを組み合わせています。

GlycoScape™ データレビュー
GlycoScape™ が提供する統合ビューアを使用して、高レベルの実験情報から特定のフラグメントイオンスペクトルまで、データのあらゆる側面を自信を持って表示します。

スマート - 取得コントロール
GlycoScape™ は、サンプル取得の最後にユーザー定義の糖ペプチドの適格性/パラメータを許可し、適合性をチェックしながら、また貴重なサンプル、高価な消耗品、および計測時間を節約しながら、サンプルキューの進行をシームレスにガイドします。

多用途の糖鎖同定
データベースフリーのMyriad Glycan Identificationを使用して、データベースに存在しない新規の糖鎖を同定してください。ユーザー定義の単糖を使用して、新しい糖鎖や修飾を探索しましょう。

Myriad ワークフロー – リアルタイム糖ペプチド同定

最初に Myriad ワークフローを説明したのは Armony らでした(https://doi.org/10.3390/ijms24097869)。このワークフローは、一般的な N-結合型糖鎖フラグメントを使用して、糖ペプチドフラグメンテーションスペクトルをペプチドと糖鎖部分スペクトルに効果的に分解します。次に、各部分は特殊なリアルタイムアルゴリズムによって同定され、その後糖ペプチドが「再構成」されます。Myriad ワークフローの大きな利点は、糖鎖データベースを必要とせず、データベースにない糖鎖を同定し、偽陰性を最小限に抑えることができることです。

Myriad ワークフローは、glyco-PASEF データ取得の速度に対応し、他の糖プロテオミクスソフトウェアスイートと同様のパフォーマンスを実現します。文献参照データに沿って即座に結果を生成するため、分析時間の要件が大幅に削減されます。

オランダのナイメーヘンにあるラドバウド大学医療センターの Hans Wessels 博士、Gad Armony 博士、Dirk Lefeber 博士、Alain van Gool 博士は、Health-Holland との官民パートナーシッププログラム (助成金番号 LSHM21032) に基づき、ブルカーと共同で Myriad アルゴリズムを開発しました。このアルゴリズムは GlycoScape™ に統合されており、すべての timsTOF ユーザーにリアルタイムの糖ペプチド同定を提供します。

eXd-Enabled Glycoproteomics

GlycoScape™ v2026b introduces the Myriad-Sage N-Glycopeptide workflow, bringing together database-free glycan identification via Myriad decomposition paired with the Sage peptide search engine — now supporting eXd-acquired N-glycopeptide spectra from timsOmni.

Confidently characterize glycopeptides while preserving fragile glycan structures, with full support for glycan localization and topology insights. Validate your results effortlessly with interactive visualization of eXd fragment ions within annotated MS/MS spectra, including complete a/x, b/y, and c/z peptide fragment ion coverage alongside B/Y glycan fragments. Generate extracted ion chromatograms and mobilograms for any identified precursor — all within the integrated GlycoScape™ viewer.

With eXd-based glycoproteomics now fully integrated, deeper glycan characterization has never been more accessible.

私たちの研究室は、中枢神経系における糖鎖構造の異質性と、加齢に伴う神経疾患におけるその変化を解明することを目指しています。私たちは、イオンモビリティを統合した質量分析法 (Bruker の timsTOF) を利用して、変化したグリコシル化がタンパク質の構造と機能にどのように影響するかを調査します。timsTOF での PASEF データ取得により、糖ペプチドの豊富なフラグメンテーションスペクトルが提供されます。GlycoScape と組み合わせることで、重要な糖ペプチドを確実に特定できると同時に、実用的な結果を得るまでの時間を短縮できます。

Melissa Baerenfaenger, Ph.D., Assistant Professor, Vrije Universiteit Amsterdam, Netherlands

Bruker の ProteoScape の姉妹製品である GlycoScape は、timsTOF プラットフォームからの糖タンパク質質量分析データの分析を、糖鎖データベースの制約を受けることなく即座に処理可能にするものです。

Hans Wessels, Ph.D., Proteomics Scientist, Radboud University, Nijmegen, Netherlands