结果即时呈现
实时结果 = 效率
通过整合 GlycoScape™ 提供的实时糖肽鉴定和智能数据采集,克服数据分析瓶颈。
普遍可用 (Universally available)
所有当前及未来的 timsTOF Pro、timsTOF HT、timsTOF fleX、timsTOF SCP 和 timsTOF Ultra 平台均可使用 GlycoScape™。GlycoScape™ 已便捷地和布鲁克ProteoScape™ 捆绑,无需额外费用。
4D-糖基化蛋白质组学 (4D-Glycoproteomics)
即使是那些较大的 CCS 采集数据,使用 GlycoScape™ 也能实现实时糖肽鉴定。GlycoScape™ 利用 GPU 加速的 ProLuCID 算法进行肽段鉴定,并结合了用于聚糖组成的 Myriad 算法。
GlycoScape™ 数据审核 (GlycoScape™ data review)
使用 GlycoScape™ 提供的集成查看器,可以自信地查看数据的各个方面,从高级实验信息到感兴趣的特定碎片离子谱图。
智能 - 采集控制 (Smart - Acquisition Control)
GlycoScape™ 是智能的,允许用户在样品采集结束时限定糖肽鉴定数量的标准/参数,以智能指导样品队列的推进,同步检查仪器状态来实现节省珍贵样本、昂贵耗材和仪器时间。
Myriad 工作流程首次被 Armony 等人提出 (https://doi.org/10.3390/ijms24097869)。该工作流程使用常见的 N-聚糖片段,将糖肽碎片谱图有效解卷积分为肽段部分的谱图和聚糖部分的谱图。每部分谱图随后由专门的实时算法进行鉴定,之后糖肽被“重新组装”。Myriad 工作流程的一个显著优势是它不需要任何聚糖数据库即可实现鉴定,能够鉴定数据库中不存在的聚糖并最大程度地减少假阴性。
Myriad 工作流程能够跟上 glyco-PASEF 数据采集模式的速度,实现了与其他糖蛋白组学软件套件相当的性能,并且与文献参考数据一致,同时即时产生结果,大幅减少了分析所需时间。
荷兰奈梅拉德堡德大学医学中心的 Hans Wessels 博士、Gad Armony 博士、Dirk Lefeber 教授(博士)和 Alain van Gool 教授(博士)与布鲁克在 Health-Holland( LSHM21032)的公私合作伙伴项目下协作开发了 Myriad 算法。该算法已集成到 GlycoScape™ 中,为所有 timsTOF 用户提供实时糖肽鉴定。
“ 我们实验室旨在破译中枢神经系统中糖基化的结构异质性及其在衰老相关神经系统疾病中的改变。我们利用离子淌度质谱(布鲁克的 timsTOF)的技术来研究糖基化改变如何影响蛋白质结构与功能。timsTOF 上的 PASEF 数据采集为糖肽提供了丰富的碎片谱图。结合 GlycoScape,我们能够可靠地鉴定关键糖肽,同时减少了获得结果所花费的时间。”
Melissa Baerenfaenger, Ph.D., Assistant Professor, Vrije Universiteit Amsterdam, Netherlands
“ 布鲁克 ProteoScape 的同类型产品 GlycoScape 目前已经支持对 timsTOF 平台产出的糖蛋白组学质谱数据进行实时分析且不依赖糖库的限制。”
Hans Wessels, Ph.D., Proteomics Scientist, Radboud University, Nijmegen, Netherlands
*仅供研究使用,不能用于临床诊断程序。