TimsTOFPro keyvisual version5

timsTOF Pro - The new standard for 4D shotgun proteomics

Powered by PASEF

Download poster hall Proteomics/ PASEF

質量分析(MS)ベースのプロテオミクスは数千ものタンパク質の同定・定量のための強力なテクノロジーです。しかし、完全なプロテオームの適用範囲は、現在の質量分析計の速度、感度、分解能が限られているため、依然として非常に困難です。

timsTOF Proは、PASEF(Parallel Accumulation Serial Fragmentation) 取得メソッドを使用して、サンプル量の少ないショットガンプロテオミクスやリン酸化プロテオミクスの新しい深度に到達するための非常に高速でかつ感度を提供します。

Timstof pro 200px

ほぼ100%のデューティーサイクルをショットガンプロテオミクスで達成

デュアルTIMS技術により、高感度、高速ショットガンプロテオミクスのほぼ100%デューティサイクルを実現しました。新しい設計では、イオンが前部に蓄積されるのを可能にし、後部のイオンはイオン移動度に応じて同時に放出されます。このプロセスは、パラレル・アキュムレーション・シリアル・フラグメンテーションまたはPASEFと呼ばれます。

さらなるディープ・プロテオミクスへ – PASEF

PASEFを搭載したtimsTOF Proは、四重極分離質量ウィンドウをTIMSファネルからの特定のペプチドパッケージの溶出時間と同期させることにより、感度を失うことなく、> 100 Hzのシーケンス速度を提供します。

MaxQuant/Perseus と PEAKS Studioでデータプロセッシングが可能に

オープンファイルデータフォーマットにより、研究者は生データを直接操作して、業界をリードするソフトウェアを使用することができます。 MaxQuantは、ペプチド、タンパク質、翻訳後修飾の同定と定量化に役立つ保持時間、イオン移動度、質量、シグナル強度にまたがる領域で4D機能を管理するように適応されています。 PEAKS Studioは、デノボシーケンシングと従来のデータベースベースの検索を組み合わせ、生のデータを処理するために最適化されています。

Interview and presentation given by Prof. Juergen Cox at US HUPO 2019

Matthias Mann 70px

"We now know that the peptide mixtures are still extremely complex when analyzing them in two dimensions (retention time and m/z). Adding one more dimension should in principle get us a long way ahead. In addition to the additional dimension of separation, the timsTOF Pro gives us extremely high speed and sensitivity to get deeper into the proteome and using less sample material.”

Prof. Dr. Matthias Mann, Director Department of Proteomics and Signal Transduction,
Max-Planck-Institute of Biochemistry, Germany

timsTOF Pro - PASEFテクノロジーを搭載した唯一の質量分析計

卓越したハードウェアパフォーマンス

第二世代デュアルTIMSアナライザーは、ショットガンプロテオミクスのニーズに最適化されています。 TIMSアナライザーの第2の部分からの移動度に応じてイオンが放出されるユニークな構造のため、TIMSアナライザーの第1の部分ではさらなるイオンが並行して蓄積されます。並列蓄積技術により、100%までのデューティサイクルが達成され、イオン損失は生じません。

timsTOF Proでは高度なセグメント化された四重極マスフィルターが高いイオン透過と分離効率のために使用されています。四重極質量位置は、TIMSアナライザーからの特定のイオンの溶出時間と同期する。マスポジション切換時間(<1 ms)が非常に高いため、PASEF方式で最高の性能を発揮します。

Optimized for shotgun proteomics version2
timsTOF Proの回路図

TIMS

トラップド・イオンモビリティースペクトロメトリー(TIMS)は、HPLCと質量分析に加えて分離モードを追加してサンプルの複雑さを解決し、化合物の特性評価におけるピーク容量と信頼性を向上させる、気相における分離技術の第一歩です。

PASEF

スピードを念頭に置いて、Brukerのエキスパートはショットガンプロテオミクスの要求を満たすためにMS / MS技術を再設計しました。ペプチドイオンは、トラップされたイオンモビリティーを用いて分離、透過(約100ms)、そしてQTOFで検出され、TIMS MSヒートマップ(A)が生成される。 PASEF法(B)では、同じTIMS分離が四重極と共に連動され、その四重極では、溶離中に特定のイオン種をアイソレーションし、次の前駆体に直ちに移行される。プリカーサーおよびフラグメントスペクトルは、移動度値によって整列されます。 PASEF(パラレル・アキュムレーション・シリアル・フラグメンテーション)テクノロジ> 100 Hzのシーケンシング速度で達成できます。 PASEF法を用いて、低濃度レベルのペプチドのMS / MSスペクトルのクオリティーを数回選択することによって増加させることができます。

PASEF サイクルタイム

Powered by PASEF
PASEF(パラレル・アキュムレーション・シリアル・フラグメンテーション)サイクルタイム:四重極とTIMS溶出時間を同期させることにより、平均12個の前駆物質を100 msタイムスケール内で断片化することができます。インテリジェントなソフトウェアは、PASEF MS / MSフラグメンテーションのために低濃度レベルのプリカーサーイオンを複数回標的とします。

timsTOF Pro - Re-defining proteomics throughput and sensitivity

Speed and sensitivity translating into high proteome coverage

The combined power of trapped ion mobility spectrometry (TIMS) and Parallel Accumulation Serial Fragmentation (PASEF) allows for greater proteome or sub-proteome (e.g. Phosphoproteome) coverage without requiring the large sample amounts (typically 1-4µg of a peptide mixture on column) often used in proteomics.

Superior results can be obtained from less than 200ng sample load, therefore reducing both sample preparation costs and MS maintenance frequency. Using a 90 min gradient length more than 5,400 protein groups can be identified from a typical human cell line lysate. The timsTOF Pro can also deliver reproducible quantitative information from smaller amounts of highly complex mixtures.

Deep proteome coverage using short gradients

For Research Use Only. Not for Use in Clinical Diagnostic Procedures.