データを知識に変える
1つのソフトウェアで分析と可視化
ブルカーのソフトウェアを使用することで、MALDIイメージングデータの統計解析がこれまでになく簡単になりました。
基本の可視化と処理
システム要件
以下のシステム要件に該当します。
SCiLS Lab™ は、ブルカーの FLEX シリーズや MRMS などを含む主要な質量分析メーカーからのデータに加え、オープンな imzML フォーマットで提供されるデータセットを統合します。
複数のサンプルの比較分析を 2D と 3D の両方で可視化することができ、医薬品開発、組織分解バイオマーカー研究、免疫組織化学を補完するトランスレーショナルな病理学研究など、多くのアプリケーションを可能にします。
SCiLS Lab™ の MSI 定量化ワークフローは、組織から直接標的分子を簡単に定量することを可能にします。SCiLS™ LabはMetaboScape® のSpatialOMxワークフローと統合し、アノテーションされた検出成分(代謝物、脂質、糖鎖)のMALDI分子組織イメージを可視化します。
timsTOF fleXイオンモビリティデータについて、SCiLS Labはモビリティ画像を表示することができ、CCSを考慮したデータ解釈を可能にします。
SCiLS™ Lab は、1 つ以上の MALDI イメージング データセット の解析に使用することができます。複数のデータセットをロードし、タイル状に空間的に整列させることができます。事実上サイズ無制限のデータセットの組成を可視化し、詳細な解釈のために統計的に分析することができます。また、SCiLS™ Lab は、連続した 2D データセットからの 3D MALDI イメージングデータの構築、および 3D MALDI イメージングデータの可視化と解析に使用することができます。
臨床病理学における大規模コホートサンプル
先駆的なバイオマーカー研究では、 識別イオン の発見は手動で行うか、カスタムスクリプトを使用して行われていました。バイオマーカー研究では分析すべきサンプル数が膨大なため、手動でのデータ分析は時間がかかり、エラーが発生しやすいです。SCiLS Labでは、病態生理学的変化を識別する特徴的なスペクトルの自動解明を簡単に行うことができるようになりました。SCiLS Labは、ワンクリックですべてのイオンが異なる生物学的状態をどの程度識別しているかを自動的に定量化します。結果として得られた新規バイオマーカー候補のリストは、その後の分析のために簡単にエクスポートすることができます。
SCiLS™ Labのパワフルなデータマイニング機能をご覧ください。
全身イメージング
2006 年に実施された先駆的な研究において、全身 MALDI イメージングは、方法論だけでなく計算の側面にも挑戦しました。全身組織切片内の 薬物および代謝物の分布 を可視化するために、商用、学術用、およびカスタムのさまざまなソフトウェアを使用して、いくつかの手動データ処理が実行されました。
現在では、何百万ものスペクトルからなるデータセットのすべての処理が、1つのソフトウェアを使用して実行できるようになりました。SCiLS™ Lab は、1つの解析ファイルへの複数のデータセット登録から、スペクトルの前処理、包括的な統計解析まで、データ解析のワークフロー全体を提供します。
"SCiLS™ Lab を使用することで、私たちのチームは手動での比較にかかる無限とも言える時間を節約することができました。このユニークな機能は、私たちが待ち望んでいたものでした。"
研究用途限定。臨床診断用にはご利用いただけません。