TimsTOFPro keyvisual version5

Szczegóły techniczne

Możliwy dzięki PASEF

Spektrometria na bazie spektrometrii masowej (MS) stała się potężną technologią do identyfikacji i kwantyfikacji tysięcy białek. Jednak pokrycie kompletnych proteomów wciąż jest bardzo trudne ze względu na ograniczoną szybkość, czułość i rozdzielczość obecnych spektrometrów mas.

 

 

The timsTOF Pro wykorzystuje metodę równoległej akwizycji szeregowej akumulacji (PASEF), aby zapewnić ekstremalnie wysoką prędkość i czułość, aby osiągnąć nową głębokość w proteomice shotgun i fosfoproteomice przy użyciu niewielkich ilości próbek.

Timstof pro 200px

Osiągnij blisko 100% cykl pracy dla proteomiki "shotgun"

 

W przypadku technologii podwójnego TIMS można teraz osiągnąć prawie 100% cykl pracy dla proteomiki o dużej czułości i prędkościi shotgun. Nowatorska konstrukcja pozwala na gromadzenie się jonów w przedniej części, natomiast jony w tylnej części są uwalniane jednocześnie w zależności od ich mobilności jonowej. Proces ten nosi nazwę równoległej kumulacji fragmentów seryjnych lub PASEF.

PASEF – wnikliwsza metoda badania proteomu

 

TimsTOF Pro zasilany przez PASEF oferuje prędkość sekwencjonowania> 100 Hz bez utraty czułości poprzez synchronizację liniowej izolacji jonowej z czasem wymywania określonych pakietów peptydów z dyszy TIMS.

MaxQuant/Perseus and PEAKS Studio enabled data processing

Otwarty format danych pozwala badaczom bezpośrednio pracować z nieprzetworzonymi danymi i korzystać z wiodącego oprogramowania. MaxQuant został zaadaptowany do zarządzania funkcjami 4D w przestrzeni łączonej przez czas retencji, ruchliwość jonów, masę i intensywność sygnału, co sprzyja identyfikacji i kwantyfikacji peptydów, białek i modyfikacji posttranslacyjnych. Studio PEAKS łączy w sobie sekwencjonowanie de novo z tradycyjnymi przeszukiwaniami baz danych i jest zoptymalizowane do przetwarzania surowych danych z timsTOF.

Interview and presentation given by Prof. Juergen Cox at US HUPO 2019

Matthias Mann 70px

"Teraz wiemy, że mieszanki peptydów są nadal niezwykle złożone, gdy analizujemy je w dwóch wymiarach (czas retencji i m / z) jest niewystarczające. Dodanie kolejnego wymiaru powinno być dla nas wielkim krokiem do przodu. Poza dodatkowym wymiarem separacji, timsTOF Pro daje nam ekstremalnie wysoką prędkość i czułość, aby dogłębnie zbadać proteom i zużywać mniejszą ilość próbki. "

 

Prof. Dr Matthias Mann, dyrektor Zakład Proteomiki i Transdukcji Sygnałów, Instytut Biochemii Max-Planck, Niemcy

timsTOF Pro - Jedyny spektrometr mas z technologią PASEF

Niesamowita wydajność urządzenia

 

Podwójny analizator TIMS drugiej generacji jest zoptymalizowany do potrzeb proteomiki „shotgun”. Ze względu na swoją unikalną geometrię jony są uwalniane w zależności od ich ruchliwości z drugiej sekcji analizatora TIMS, podczas gdy kolejne jony przychodzące mogą być gromadzone równolegle w pierwszej części analizatora TIMS. Dzięki równoległej technologii akumulacji można osiągnąć cykl pracy, do 100%, co powoduje brak strat jonów.

 

W timsTOF Pro zaawansowany segmentowy filtr liniowej separacji jonowej służy do wysokiego poziomu transmisji jonów i wydajności izolacji. Kwadrupolowa pozycja masy jest zsynchronizowana z czasem elucji określonych jonów z analizatora TIMS. Ze względu na bardzo długi czas przełączania pozycji masy (<1 ms), zapewnia on najlepszą wydajność dla metody PASEF.

Optimized for shotgun proteomics version2

TIMS

Spektrometria ruchliwości jonów wychwytywanych (TIMS) jest przede wszystkim techniką rozdziału w fazie gazowej, która rozwiązuje złożoność próbki z dodatkowym wymiarem rozdziału oprócz HPLC i spektrometrii masowej, zwiększając szczytową wydajność i pewność w charakteryzowaniu związku.

PASEF

Z myślą o szybkości, eksperci Bruker przeprojektowali technologię MS / MS, aby spełnić wymagania proteomiki shotgun. Jony peptydów są rozdzielane przy użyciu spektrometrii ruchliwości jonów wychwytanych, eluowane (~ 100 ms) i wykrywane w QTOF, generując „mapę temperaturową” TIMS MS (A). W metodzie PASEF (B) stosuje się ten sam podział TIMS z kwadrupolem izolującym pewien gatunek jonów podczas jego eluowania i natychmiast przechodzącym do następnego prekursora. Widma macierzyste i fragmentowe są dostosowane do wartości ruchliwości. Dzięki technologii Parallel Accumulation Serial Fragmentation (PASEF)> prędkość sekwencjonowania do 100 Hz może zostać osiągnięta. W metodzie PASEF jakość widm MS / MS peptydów o niskiej zawartości może zostać zwiększona poprzez ich kilkakrotne zaznaczenie.

Powered by PASEF

timsTOF Pro - Re-defining proteomics throughput and sensitivity

Speed and sensitivity translating into high proteome coverage

The combined power of trapped ion mobility spectrometry (TIMS) and Parallel Accumulation Serial Fragmentation (PASEF) allows for greater proteome or sub-proteome (e.g. Phosphoproteome) coverage without requiring the large sample amounts (typically 1-4µg of a peptide mixture on column) often used in proteomics.

Superior results can be obtained from less than 200ng sample load, therefore reducing both sample preparation costs and MS maintenance frequency. Using a 90 min gradient length more than 5,400 protein groups can be identified from a typical human cell line lysate. The timsTOF Pro can also deliver reproducible quantitative information from smaller amounts of highly complex mixtures.

New proteome coverage depths using low sample amounts
Deep proteome coverage using short gradients

For Research Use Only. Not for Use in Clinical Diagnostic Procedures.