NMR ソフトウェア

TopSpin

TopSpin®ソフトウェアの最新リリースである4.0は、新しいユーザーフレンドリーなGUIを特徴としており、産業界や学術研究機関の両方で利用される標準的なBrukerパルスシーケンスやユーザーが生成した実験のライブラリを含む膨大な実験ライブラリに容易にアクセスできます。
topspin

ハイライト

スマート測定
ルーチン分析者からエキスパートの方まで、効果的なワークフローにより、高品質なデータを最短の時間で取得することができます。
高度な処理
高速で柔軟なアルゴリズムによる処理および解析が可能です。
多彩なアプリケーション
豊富なアドオンによって、幅広いアプリケーションに対応します。
順応型のワークフロー
内蔵のスクリプトを使用してワークフローを自動化できます。

TopSpin®ソフトウェアの最新リリースである4.0は、新しいユーザーフレンドリーなGUIを特徴としており、産業界や学術研究機関の両方で利用される標準的なBrukerパルスシーケンスやユーザーが生成した実験のライブラリを含む膨大な実験ライブラリへ容易にアクセスできます。このGUIは、カスタマイズされた実験ライブラリをドラッグ&ドロップで簡単に構築して整理することができ、実験のセットアップと最適化のための様々なオプションがあり、スクリプトベースのパラメータ調整が可能で、洗練された実験のセットアップを簡単かつ効率的に行うことができます。またGxP対応が必要なお客様向けに、複数のデータインテグリティの原則をサポートしています。

TopSpinは、完全にワークフロー指向のユーザーインターフェースとなっており、最適なメモリー使用のためにWindows / CentOS / macOSオペレーティングシステムの最新の64ビット機能を用います。新しいワークフロー指向で直感的なユーザーインターフェースと、最適化されたサンプルデータ管理によって、多くの革新的な機能が追加されており、操作とサンプル分析のスループットを高速化し、より高いコスト効率を実現します。

TopSpinは、ワープロ、グラフィックス、プレゼンテーションプログラムで最も普及している標準規格を採用した、非常に直感的なインターフェースとなるように設計されており、Windows®、Linux®、Mac上で同じ外観と操作性のNMRアプリケーションを提供しています。

特長

TopSpinの特長

  • AvanceおよびFourier分光計のフルコントロール
  • 業界標準の直感的なユーザーインターフェース、ルーチンユーザーと専門家の両方に最適なソリューション
  • 一次元あるいは多次元スペクトルの処理・表示・解析のための総合的な機能
  • 測定の補助機能
    - 実験のセレクター
    - 先進的なNon Uniform Sampling法
    - bioTop
    - TopSolids
  • メソッド開発環境
  • 柔軟性のある自動化(scripting)
    - AUプログラム
    - Python (jython)
  • 法規制対応のためのデータインテグリティのサポート(監査証跡、電子署名、自動アーカイブなど)
  • 無制限のオフラインデータ処理機能
  • 結果レポート、ブルカー標準定義およびユーザー定義のレイアウト
  • 総合的な解析ツール
    - 低分子化合物のシンプルかつ効率的な構造解析
    - 低分子の特性評価
    - Dynamic NMRを含む固体NMRの線形解析
  • 教育用パッケージ
    - 学生や大学専用のライセンス
    - NMRガイド
    - NMR実験のシミュレーション
    - CMC-se およびCMC-assistの教育用パッケージ

Experiment Selector - 直感的な条件設定を可能に

Topspinには、多数の実験(パラメーターセット)が含まれています。この中で最も重要なものは、TopSpinのExperiment Selectorで利用できます。
パラメーターセットは、カテゴリー別のツリーに表示されます。このことで、求められる柔軟性と操作性が両立されています。選択されたパラメーターセットに基づいて実験を準備するには、マウスを1回クリックするだけです。
NMRのユーザーは、自分で使い易い独自のセレクターを作成することができます。

アプリケーション

Non Uniform Sampling

Non Uniform Sampling (NUS)を用いたスペクトル測定および処理機能は、TopSpin 3.0から完全に統合されました。ルーチンで使用することができ、あらゆる種類の多次元NMR実験に適用できます。自動で生成され、最適化されたNUSスパースリストは、ランダムにかつ不連続にFIDを取得するサンプリングパターンを定義します。MDD法により欠損データポイントを計算することで、データポイントを再構築し、通常のフーリエ変換処理を可能にします。

2Dスペクトルの低分子アプリケーションでは、たとえば、取り込むポイント数を半分に設定すると、2倍の速さでスペクトル測定が可能です。 ここで特に注目されるのは、全体の測定時間を増やすことなく、NUSによって提供されるスペクトル分解能と品質が向上する点です。

NUSは、高分解能多次元NMR実験の長時間かかるという問題を解消します。特に生体分子NMRのための多次元実験に有用であり、三次元、四次元、五次元実験と次元が上がるにつれてシグナルの分離能が上がるので、さらにNUS向きとなります。その結果、サンプリングするポイント数をさらに減らすことができるので時間短縮の効果がいっそう増します。 NUSを使用することで、新しいタンパク質構造決定実験が可能になります。

NUS実験のセットアップと実行はTopSpinライセンスでカバーされ、2Dスペクトルの処理も含まれます。3D - 5D NUSスペクトルの処理には、追加ライセンスが必要です。

TopSpinにおけるNUSの実装は、Orekhov教授との共同研究の成果です。TopSpin 3.0のNUSは、NUSのスケジュールやMDD法による再構築などの実績のあるアルゴリズムやプログラムを利用しています。(Orekhov, V.Y., I. Ibraghimov, and M. Billeter, J. Biomol. NMR, 2003. 27(2):p. 165-173)

高度な測定ツール

Topspinには、 shaped pulseを用いた実験のセットアップと実験デザインをサポートする豊富なツールが用意されています。新しい波形を設計し、その励起プロファイルを視覚化することができます。

教育向けのツール

Topspinのデータ処理ライセンスはアカデミア向けに無料で提供されています。このライセンスには、NMR実験の理解と取得したデータの解析をサポートするツールが含まれています。
 
 
NMRSim
 
NMRSimは、一次元および二次元NMR実験の完全な機能を備えたシミュレーターです。標準的なブルカーのパルスプログラムを解釈し、実際の装置で実行されるのと同じ方法でNMR実験をステップごとにシミュレーションします。その結果が標準的なブルカーのデータセットとなり、ブルカーのNMRデータセットと同じように処理されます。このシミュレーションは、 選択励起パルスや磁場勾配パルスにも対応しています
 
NMR-Simは、教育や科学分野で仮想NMR分光計として使用することができます。
 
CMC ClassRoom
 
Topspinのアカデミア向けライセンスには、CMC ClassRoomソフトウェア版のライセンスが含まれています。このツールで、低分子の構造検証や構造解析のための基本的なワークフローを学ぶことができます。

Just one click from chemical structure to spectra. NMR features are predicted on the fly and used to calculate the spectra.
Simulation of 2D COSY using the magnetic field gradients for coherence selection. Changing the relative sign of gradient pulses switched between the P and N type of spectra.

仕様

サポートされているオペレーティング システム

TopSpin 4は64ビットのオペレーティングシステムが必要です。分光計の制御にはWindows 7, 10, CentOSが必要です。解析用のTopSpinはmacOSにも対応しています。サポートされているオペレーティングシステムの詳細はサービスのページを参照してください。

ソフトウェア

Please add a Collection ID

ウェビナー

ニュース&イベント

詳細

詳細情報

サポート

サポート